In dieser historischen Periode wurden Spuren eines Palastes entdeckt, zu dem ein Megaron gehörte, ein Innenhof, der für Audienzen und Versammlungen genutzt wurde. Es lässt sich nicht mit Sicherheit sagen, ob zu dieser Zeit ein der Athene geweihter Tempel existierte. Der Begriff Megaron, der griechischen Ursprungs ist, aber möglicherweise auch semitischen Einfluss hat, bezeichnete den "großen Saal", der sich gewöhnlich in den Palästen der mykenischen Zivilisation in Griechenland und Anatolien befand. Er befand sich in der Regel an einem Ende des zentralen Hofes, direkt vor dem Altar, und bestand aus drei Teilen: einem offenen Säulengang mit zwei Säulen in antis, einem Vestibül oder Vorraum und dem als naos bezeichneten Hauptsaal.

Gegen Ende der Helladischen IIIB-Periode, die die Jahre 1300-1200 v. Chr. umfasst, wurde eine imposante, bis zu 6 m dicke Mauer um die Akropolis gebaut. Auch ein Brunnen am Nordhang der Akropolis stammt aus der mykenischen Zeit, denn Keramikfunde an der Fundstelle deuten darauf hin, dass er Ende des 13. Jahrhunderts v. Chr. errichtet wurde.

Es ist umstritten, ob der Eintrag im Gefäßkatalog der Ilias, der einen Tempel im Zusammenhang mit dem athenischen Kontingent beschreibt, aus mykenischer oder späterer Zeit stammt.