Le monastère royal de Santo Tomás est un bâtiment de style gothique.

Elle a été fondée en 1480 par le trésorier des Rois Catholiques, Hernán Núñez de Arnalte, qui a donné procuration à sa femme, María Dávila, et à Fray Tomás de Torquemada pour agir en son nom pour la fondation d'un couvent dominicain à Ávila en l'honneur de Saint Thomas d'Aquin.

En 1482, sous la direction de Martín de Solórzano, commencent les travaux qui dureront jusqu'en 1493, avec des dons fournis par Don Hernán, et d'autres accordés par les Rois Catholiques, qui choisissent le nouveau couvent pour la résidence d'été et l'enterrement de l'héritier de la couronne, le Prince Don Juan, dans la tombe construite des années plus tard (1510) par Domenico Fancelli, commandée par Ferdinand le Catholique.

Il a été utilisé comme tribunal pour l'Inquisition. Ses salles ont abrité les dernières années du frère Tomás de Torquemada jusqu'à sa mort le 16 septembre 1498. C'était aussi une maison d'étude et plus tard une université.

La façade de l'église se distingue par son immense façade avec un grand arc segmentaire et deux contreforts. Ceux-ci forment un "H", la lettre initiale de Hispanidad. Les boules qui courent le long des machones abondent dans tout le bâtiment. En outre, dix statues de l'art de Burgos, réalisées par Gil de Siloé et Diego de la Cruz, sont visibles sous des auvents et des pinacles. Ceux qui sont les plus proches de la porte représentent l'Annonciation. Au milieu de la façade se trouve une grande rosace qui donne de la lumière au chœur et à l'église, et un peu plus haut, le blason des Rois Catholiques soutenu par un aigle.

L'enfant Don Juan était le fils unique des monarques catholiques, mais il est mort prématurément avant d'accéder au trône. Sa mère, Isabella, voulait laisser un sarcophage en marbre à son fils dans son testament.

La tombe est l'œuvre de Domenico Fancelli. Il a été sculpté à Gênes en 1511-1512, puis placé dans l'église du monastère. Domenico Fancelli s'est inspiré du tombeau des monarques catholiques (chapelle royale de Grenade) et de l'art italien (bronze du pape Sixte IV dans la Cité du Vatican par Pollaiuolo).