La Santa Iglesia Catedral Metropolitana de Badajoz (ou Catedral de San Juan Bautista), qui a le statut de métropole, est située sur la Plaza de España.

Après la conquête chrétienne de la ville en 1230 par le roi Alfonso IX de León, Fray Pedro Pérez a été nommé évêque. Au début de son évêché, l'ancienne mosquée a été utilisée comme cathédrale de la ville avec la dédicace de Santa María del Castillo. Deux ans après la fin de la conquête, la nécessité de construire une cathédrale est évoquée et ce n'est qu'au milieu du XIIIe siècle que les travaux commencent. Le choix du site s'est porté sur une ancienne église wisigothique ou mozarabe située dans le Campo de San Juan, un terrain situé à l'extérieur de la citadelle.

En 1276, la cathédrale a été consacrée sous le patronage de Saint Jean Baptiste, alors que les travaux de construction n'étaient pas encore achevés. La construction des aspects fondamentaux de l'édifice s'est poursuivie jusqu'au XVe siècle, avec des modifications et des ajouts successifs au cours des XVIe et XVIIe siècles qui ont donné à la cathédrale son aspect actuel, et elle n'a été complètement achevée qu'au XVIIIe siècle.

De l'extérieur, et compte tenu du caractère frontalier de la ville, la cathédrale de Badajoz ressemble à une forteresse : elle possède de solides murs, des créneaux et une tour sobre et puissante où se trouve le clocher.