Wenige Meter vom Barockportal, das zur Kirche führt, befindet sich die Puerta Real (Königliche Pforte), die zwischen zwei Türmen liegt, deren Aussehen an die Serranos-Türme in Valencia erinnert. Über diesen Zugang gelangt man in den inneren Bereich, in dem alle Räume des Klosters untergebracht sind, d. h. in die eigentliche Klausur. Er ist von einer Verteidigungsmauer umgeben, die von Peter IV. errichtet wurde, der anordnete, in der Kirche einen Raum für ein königliches Pantheon einzurichten, in dem die Gebeine der ruhmreichsten Könige des Hauses Aragon aufbewahrt werden sollten. Die Arbeiten wurden von seinem Leutnant, Bruder Guillén de Agulló, geleitet. Die Mauer mit einem Umfang von 608 Metern ist 11 Meter hoch und 2 Meter dick, hat Zinnen, Schießscharten und einen Patrouillenweg und wird von 12 polygonalen Türmen verteidigt. Zwei dieser Türme flankieren das Königliche Tor, während die Türme an den Ecken als Gefängnistürme genutzt wurden. Zu ihnen gehören der Turm der Hostien, der an die neue Sakristei angrenzt, der Turm der Narren im Nordosten und andere, die als der Prior, der Ölturm, der Eckturm, der Wappenturm, San Esteban, der Schuhmacher und der Kardinalturm bekannt sind.

Die Königliche Pforte ist ein militärisches Bauwerk aus dem 14. Jahrhundert, dessen Portal einen Rundbogen mit großen Wölbsteinen aufweist; in seinem Schlussstein hält ein Engel das Wappen der Krone, das von zwei zügellosen Löwen geschmückt wird. Auf beiden Seiten befinden sich Glocken von König Peter IV., und auf einer von ihnen ist eine lateinische Inschrift zu lesen, die darauf hinweist, dass die Arbeiten während der Regierungszeit dieses Monarchen begonnen wurden. Über dem Portal wechseln sich die königlichen Wappen mit dem des Abtes Guillermo Agulló ab, der das Portal zwischen 1361 und 1393 errichtete.

Nach dem Durchschreiten der Königlichen Pforte findet der Besucher links die Überreste der ehemaligen Räume der Konvertiten und Spender, während rechts eine Steintreppe zum Palast von König Martin dem Menschen führt, der Anfang des 15. Jahrhunderts erbaut wurde und heute als Museum dient. Gegenüber der Königlichen Pforte befindet sich das Atrium oder Vestibül des Kreuzgangs, ein Werk von Abt Copons, und links davon die Keller, die ursprünglich als Speisesaal für Laien oder Konvertiten dienten; über diesem Gebäude wurde im 14. Jahrhundert das Dormitorium für Mönche im Ruhestand errichtet, in dem 1983 das Museum zur Restaurierung des Klosters eingerichtet wurde.

Auf der rechten Seite des Atriums befinden sich die Weinpressen aus dem 13. Jahrhundert, die ursprünglich als Schlafsaal für Laien dienten, während die Südwand an die Nordwand der Kirche anschließt. Im Inneren des Atriums trifft die Ecke des Atriums auf die Nordwestseite des Kreuzgangs. Im Osten des ummauerten Bereichs befinden sich die ältesten Einrichtungen aus dem 12. Jahrhundert, wie die Stephanskapelle und die Krankenstation; außerdem liegen in diesem Bereich die königlichen Kammern, die im 14. Jahrhundert auf der Mauer errichtet wurden, und in der nordöstlichen Ecke die modernen Räume für die Mönche im Ruhestand.