Der Zentralmarkt von San Pedro im Herzen des historischen Zentrums ist nicht nur der wichtigste Markt der Stadt, sondern auch der älteste. Er befindet sich gegenüber der Plazoleta San Pedro und der Calle Santa Clara, die dem Verlauf einer alten Inka-Straße folgt, die die Hauptstadt des Tawantinsuyo mit der Region Contisuyo verband, ausgehend von der Huacaypata, dem zentralen Inka-Platz.

Die Geschichte des Marktes geht auf das Ende der 1910er Jahre zurück, während der Amtszeit von Manuel Silvestre Frisancho, der damals Bürgermeister von Cusco und Abgeordneter war. Frisancho förderte die Verlegung des Marktes von der Plaza de Armas und der Plaza San Francisco, wo traditionell die Versorgungsgeschäfte der Stadt stattfanden, in das Viertel San Pedro im Westen der Stadt. Als neuer Standort wurde die "Pampa de Qasqaparo" gewählt, ein Grundstück, das dem Kloster Santa Clara gehörte und sich gegenüber der Kirche San Pedro befand. Zu diesem Zeitpunkt befand sich in diesem Gebiet bereits der städtische Schlachthof, und die Entscheidung, den Markt dorthin zu verlegen, war vor allem durch gesundheitliche Bedenken begründet.

Der Bau des Marktes wurde in zwei Phasen durchgeführt. Die erste Phase begann 1925, und der Markt wurde am 7. Juni desselben Jahres eingeweiht, als er seinen Betrieb aufnahm. Der vollständige Bau des Marktes wurde jedoch erst 1950 abgeschlossen. Der älteste Teil des Bauwerks wurde von dem französischen Bauingenieur Gustave Eiffel entworfen, der von Bürgermeister Frisancho mit dem Projekt beauftragt wurde. Das Bauwerk war seinerzeit die größte überdachte Fläche, die in Cusco gebaut wurde, und war zunächst im Volksmund als "Mercado Frisancho" bekannt. Emilio Astete war sein erster Verwalter.

Nach dem Erdbeben von 1950 und dem daraus resultierenden Bevölkerungswachstum in Cusco wurde das Gebäude 1955 vergrößert, was den Abriss des südlichen Blocks des Marktes zur Folge hatte. Von diesem Zeitpunkt an wurde der San Pedro-Markt zum wichtigsten Handelszentrum der Stadt und brachte eine große Dynamik in die umliegenden Straßen.

Das Gebäude zeichnet sich durch sein neoklassizistisches Design aus und besteht hauptsächlich aus Eisen, mit einem Kalamindach, Metallgittertüren und Betonwänden und -böden. Das dreistöckige Giebeldach wird von einer Reihe von Säulen getragen, die über den rechteckigen Block verteilt sind. Die Säulen, deren Größe je nach Standort variiert, sind in der Mitte höher und nehmen zu den Seiten hin in Höhe und Dicke ab. Sie sind alle mit Beton verkleidet. Die Eisenbinder werden mit thermisch angezogenen Nieten zusammengefügt, was eine solide Konstruktion gewährleistet. Darüber hinaus ergänzen Zug- und Scherenbalken aus importierter araukanischer Kiefer und Oregon-Kiefer diese ausgeklügelte Struktur. Die zweite Phase des Marktes, die sich im Südosten befindet und für den Verkauf von Fertiggerichten vorgesehen ist, hat das ursprüngliche Design beibehalten.

Im Laufe der Jahre hat sich der Mercado de San Pedro von einem traditionellen Lebensmittelmarkt zu einem Markt mit touristischem Schwerpunkt entwickelt. Heute verfügt er über 1180 Stände, die sowohl innerhalb des Marktes als auch in den angrenzenden Straßen für regen Handel sorgen. Der Markt ist in Blöcken organisiert, die sich durch die Art der angebotenen Produkte unterscheiden, von Lebensmitteln, Fleisch, Obst und Gemüse bis hin zu Kleidung und Artikeln, die mit dem Schamanismus der Anden zusammenhängen. Dieser Markt ist nicht nur für Einheimische, sondern auch für Touristen, die ein authentisches Erlebnis in Cusco suchen, zu einem Bezugspunkt geworden.