Das Kartäuserkloster Santa María de Miraflores ist ein Kloster des Kartäuserordens, das auf einem Hügel namens Miraflores errichtet wurde und etwa drei Kilometer vom Stadtzentrum von Burgos entfernt liegt.

Es ist ein Juwel der spätgotischen Kunst. Das herausragendste Merkmal des Komplexes ist die Kirche, deren Westfassade im elisabethanischen Gotikstil mit den Wappen der Stifter verziert ist. Die Kirche besteht aus einem einzigen Schiff, Seitenkapellen und einer polygonalen Apsis. Das Kirchenschiff ist mit einem sternförmigen Gewölbe bedeckt.

König Johann II. von Kastilien schenkte dem Kartäuserorden den Palast und die Festung Miraflores, die 1401 von seinem Vater, Heinrich III. von Kastilien, erbaut worden waren. Es war ein Jagdhaus am Rande der Stadt Burgos. Auf diese Weise erfüllte Johannes II. den testamentarischen Willen Heinrichs III.

Das Kartäuserkloster Miraflores wurde im Jahr 1442 gegründet. Nach einigem Zögern der Mönche, weil es zu kalt war und es an Wasser fehlte, wurde die Gemeinschaft gegründet und das Gebäude unter das Patronat von San Francisco (Kartäuserkloster San Francisco de Miraflores) gestellt. Die Mönche, die aus anderen spanischen Kartäuserklöstern kamen, ließen sich in der Palastburg nieder. Dieses erste Kloster überdauerte jedoch nicht lange, da es 1454 durch einen Brand zerstört wurde.

Im Jahr 1453 wurde der Bau des heutigen Gebäudes beschlossen. Zwischen 1454 und 1488 wurde an dem neuen Kloster gearbeitet, das nun unter dem Patronat von Santa María de la Anunciación (de Miraflores) stand. Das Werk wurde bei Juan de Colonia in Auftrag gegeben, der zu dieser Zeit an der Kathedrale von Burgos arbeitete, und 1454 begonnen. In diesem Jahr trat Heinrich IV. die Nachfolge seines Vaters Johannes II. an, und die Arbeiten kamen praktisch zum Stillstand.

Es war im Jahr 1477, als sie von Königin Isabella der Katholischen gefördert wurden. Während ihrer Regierungszeit wurden das Hochaltarbild und das Grabmal von Johannes II. von Kastilien und Isabella von Portugal im Presbyterium fertiggestellt. Die Kartäuserkirche ist vor allem ein königliches Pantheon, das von der Familie Isabellas bewohnt wird.

Als Juan de Colonia starb, setzte Garci Fernández de Matienzo die architektonischen Arbeiten fort. Er starb 1478 an der Pest und wurde von Simón de Colonia, dem Sohn von Juan de Colonia, abgelöst. Die Arbeiten an der Überdachung der Kirche wurden um 1484 abgeschlossen.

Zwischen 1532 und 1539 wurden unter der Leitung von Diego de Mendieta weitere architektonische Arbeiten im Kloster durchgeführt, um die Seitenkapellen (nur auf der linken Seite) zu errichten und der Kirche mehr Höhe zu verleihen. Außerdem wurden Türme und Zinnen hinzugefügt und eine gotische Bekrönung angebracht.