Le couvent de San Marcos est l'un des grands joyaux architecturaux de la ville espagnole de León, avec la cathédrale, la basilique de San Isidoro et la Casa Botines. Aujourd'hui transformé en Parador de Turismo de España, ainsi qu'en église consacrée et, autrefois, en musée de León, il est l'un des monuments les plus importants de la Renaissance espagnole.

Les origines de ce bâtiment remontent au XIIe siècle, lorsqu'à l'époque d'Alphonse VII de León, sa sœur, l'Infante Sancha Raimúndez, fit une donation en juillet 1152 pour la construction d'un modeste bâtiment aux abords de la ville fortifiée et sur les rives de la rivière Bernesga, dans lequel pourraient séjourner " les pauvres du Christ ", devenant ainsi un temple-hôpital pour le refuge des pèlerins sur le chemin de Saint-Jacques-de-Compostelle. Le bâtiment était également la résidence principale de l'Ordre de Santiago dans le royaume de León.

En 1176, le premier prieur fut élu et en 1184, Pedro Fernández de Castro, le premier maître de l'Ordre de Santiago, fut enterré dans son église.

Au XVIe siècle, le bâtiment médiéval étant en mauvais état, il a été démoli et de nouveaux travaux ont été réalisés grâce à une donation de Ferdinand le Catholique en 1514.

Les architectes désignés pour ces travaux sont : Juan de Orozco (église), Martín de Villarreal (façade) et Juan de Badajoz el Mozo (cloître et sacristie). Cependant, ce n'est que bien après le règne de Charles Ier que le nouveau travail a été commencé.

On sait qu'en 1537, la façade principale du couvent a été construite à partir de l'entrée de l'église, qui a été consacrée en 1541.

Au cours des années suivantes, Orozco a réalisé les sculptures de la façade, le chœur a été construit et, en 1549, Juan de Badajoz a terminé la sacristie, à l'intérieur de laquelle se trouve aujourd'hui la tombe de l'évêque Juan Quiñones de Guzmán, avec une statue priante, une œuvre sculpturale attribuée à Esteban Jordán.

Les travaux furent suspendus en 1566 en raison du transfert de la communauté à Calera puis à Mérida, mais le retour des frères à San Marcos en 1602 donna une impulsion à la poursuite des travaux.

En 1615, l'escalier est construit et en 1679, la partie du cloître qui manquait encore est achevée.

Enfin, entre 1711 et 1715, le bâtiment subit une importante extension, avec la construction d'un autre mur allant de l'entrée principale vers la rivière et se terminant à la tour du palais. Ce nouveau mur imite parfaitement celui construit au XVIe siècle, et il n'y a pratiquement aucune différence artistique entre les deux moitiés de la façade.