La Santa Iglesia Catedral de Nuestra Señora de la Merced est un temple catholique, siège du diocèse de Huelva.

Créée comme couvent des Pères Mercédaires en 1605 sur l'ancien Ermitage de San Roque, elle a fonctionné comme chapelle de l'Hôpital Provincial et comme église paroissiale jusqu'à sa consécration comme cathédrale le 15 mars 1954 lors de la création du diocèse de Huelva à partir de l'archidiocèse de Séville.

Le couvent de La Merced a été construit sur ordre d'Alonso Pérez de Guzmán, 7e duc de Medina Sidonia et seigneur de Huelva à l'époque. L'église, aujourd'hui cathédrale de Huelva, servait de chapelle pour les services du couvent des Mercedarios Descalzos, et a été fondée en 1605.

La structure originale a duré à peine un siècle, car la ruine menaçait le complexe dès 1714 et le tremblement de terre de Lisbonne de 1755 a gravement endommagé l'édifice, laissant la chapelle de San Cayetano détruite. Malgré cela, le tremblement de terre suivant, en 1765, fut celui qui finit par affecter sérieusement l'église et le couvent de la Merced, nécessitant une rénovation complète. À la fin du XVIIIe siècle, sur un projet de Pedro de Silva, déjà de pur style baroque, le nouveau temple fut érigé. Ambrosio de Figueroa fut chargé des travaux et, à sa mort en 1775, Francisco Díaz Pinto les poursuivit. Cette réforme, qui allait façonner l'aspect actuel de l'église de la Merced, a duré jusqu'au XIXe siècle.

Les principaux obstacles à la longue réforme de l'église ont été l'invasion napoléonienne de Huelva en 1811, la suppression des seigneuries en 1811 (car elle était encore liée à la Maison de Medina Sidonia) et la suppression des communautés religieuses masculines par le ministre Mendizábal en 1835.

La confiscation de Mendizábal (1835), comme pour d'autres biens ecclésiastiques en Espagne, fait que le couvent de la Merced passe aux mains de l'État, en l'occurrence la Diputación provinciale (conseil provincial). Cet organisme était chargé de promouvoir la reprise des travaux à La Merced.

L'église est restée ouverte au culte et le couvent a servi d'installation militaire à partir de 1844.

Par la suite, à partir de 1861, l'ancien couvent a changé d'affectation et a abrité une école secondaire et une école normale.

Il a également abrité les sièges du Conseil provincial et de l'Institut technique général et a servi d'hôpital provincial, un troisième étage ayant été construit à cet effet en 1957.