Le château de San Marcos est une église-forteresse construite sur les fondations d'une mosquée du Xe siècle, située à El Puerto de Santa María, à Cadix, en Espagne. Elle a été érigée par le monarque Alphonse X El Sabio en l'honneur de la Vierge après la prise de la ville.

Le château de San Marcos, à El Puerto de Santa María, a été construit à partir d'une ancienne mosquée islamique qui a été transformée en église fortifiée à l'époque d'Alphonse X le Sage, vers 1264, qui a renforcé ses fondations en utilisant les vestiges d'un édifice romain voisin, l'a doté de toits voûtés et a fortifié le sanctuaire avec quatre tours, deux hexagonales et les deux autres quadrangulaires, le rez-de-chaussée de la première étant utilisé comme chapelle principale de la Virgen de los Milagros (Vierge des Miracles).

Le mur de la quibla où se trouvait le mihrab et l'aspect almohade de l'édifice sont encore préservés, comme en témoignent les lignes horizontales et lisses avec un bord relevé au sommet de la tour hexagonale et dans ses voûtes schiffées. Le roi Alfonso X a établi son nouvel ordre militaire de Santa María de España dans cette église, qui a rapidement disparu après avoir été fusionné avec l'ordre de Santiago.

En tant que château, il servait de défense contre les nouvelles invasions en provenance d'Afrique du Nord. Plus tard, Sancho IV en fit don, avec la ville, à l'amiral génois Benedetto Zaccaria, puis à Alonso Pérez de Guzmán El Bueno, qui en fit à son tour don à sa fille Leonor de Guzmán en 1306 à l'occasion de son mariage avec Luis de España, donnant ainsi naissance à la Maison de Medinaceli, seigneurs de la ville à l'époque d'Isabel de la Cerda y Guzmán.

La carte ou charte de Juan de la Cosa est une carte peinte sur parchemin, de 93 cm de haut sur 183 cm de large, qui est conservée au Musée naval de Madrid. Une inscription indique qu'il a été fabriqué par le marin Juan de la Cosa en 1500 au Puerto de Santa María (Cadix). Sa riche décoration indique qu'elle a probablement été commandée par un membre puissant de la cour des monarques catholiques. Ce personnage et cette carte ont un petit coin à côté du château de San Marcos où l'on peut voir un buste de Juan de la Cosa et une réplique de la carte dans une petite fontaine.