Die Hauptkapelle, der Chor und die Chorempore bilden den Kern der Moschee-Kathedrale. Wenn man den Chor verlässt, sieht man die Kapellen, die das Kirchenschiff umgeben; wenn man sich nach rechts wendet, sieht man als erstes den Grabstein der fünf Bischöfe, der 1554 nach den Wünschen von Bischof Leopold von Österreich aus Marmor gefertigt wurde. Es folgt die Kapelle des Dulce Nombre de Jesús, die durch ein prächtiges Gitter vom Rest der Kirche getrennt ist. Es folgen die Kapelle San Pelagio, die Kapelle Santo Tomás und die Kapelle Jesús, María und José, die im Volksmund als "Kapelle des verlorenen Kindes" bekannt ist. Nach dem Querschiff erreichen wir das Querschiff, das von gotischem Maßwerk bedeckt ist, das auf der linken Seite mit Prophetenbüsten und auf der rechten Seite mit weiblichen Figuren, die möglicherweise die Tugenden darstellen, verziert ist.

Der hintere Teil weist fünf Bögen auf, von denen vier für Kapellen bestimmt sind und der fünfte die Eingangstür zur Sakristei darstellt. Über den Bögen befindet sich ein Gesims mit Grotesken und Tondos mit Büsten, und auf den fünf Tympanons sind Reliefs zu sehen, die den "Prendimiento", den "Camino del Calvario", die "Crucifixión", den "Descendimiento" und die "Resurrección" darstellen, alles anonyme Werke einer lokalen Werkstatt vom Beginn des 16. Jahrhunderts, die stark von den Flamen beeinflusst war. Neben der Tür zur Sakristei befindet sich die Kapelle des Heiligen Barnabas, gefolgt von der Kapelle des Schutzengels und der Kapelle der Darstellung.

Hochaltarbild

Der Bau des Altaraufsatzes der Hauptkapelle begann 1618 und wurde im manieristischen Stil von Alonso Matías entworfen.49 1627 wurden die architektonischen Arbeiten von Juan de Aranda Salazar fortgesetzt, und der Altaraufsatz wurde 1653 fertiggestellt.99 Die Skulpturen wurden von den Künstlern Sebastián Vidal und Pedro Freile de Guevara ausgeführt. Die ursprünglichen Gemälde stammen von Cristóbal Vela und wurden 1715 durch die von Antonio Palomino ersetzt. Das Altarbild ist in drei Abschnitte unterteilt, die von zusammengesetzten Säulen flankiert werden. Der Mittelteil beherbergt den Tabernakel im Sockel, der von Pedro Freile de Guevara geschaffen wurde, während der obere Teil eine Leinwand mit der Darstellung der Himmelfahrt enthält. Die Seitenteile beherbergen die Gemälde der vier Märtyrer: San Acisclo und Santa Victoria in der unteren Hälfte und San Pelayo und Santa Flora in der oberen Hälfte. Die oberen Leinwände werden von den Skulpturen des Heiligen Petrus und des Heiligen Paulus flankiert, und der mittlere Teil wird von einem Relief des Gottvaters gekrönt.

Chor

Das Chorgestühl, das sich vor dem Hauptaltar befindet, wurde von Pedro Duque Cornejo zwischen 1748 und 1757 geschaffen.4963100 Das hauptsächlich aus Mahagoniholz geschnitzte Gestühl besteht aus einer Reihe von 30 Stühlen im oberen Bereich und einer weiteren Reihe von 23 Stühlen im unteren Bereich, die alle aufwändig mit Reliefs verziert sind, darunter eine Reihe von ikonografischen Szenen. Die Reliefs im oberen Teil zeigen auf der rechten Seite das Leben Jesu Christi und auf der linken Seite das Leben der Jungfrau Maria, während die kleinen Medaillons allesamt Szenen aus dem Alten Testament darstellen; der untere Teil zeigt außerdem Szenen der kordovanischen Märtyrer. In der Mitte des Ensembles auf der Westseite steht ein großer bischöflicher Thron, der 1752 in Auftrag gegeben wurde und dem Entwurf eines Altars ähnelt. Der untere Teil des Throns beherbergt drei Stühle, doch das beeindruckendste Element ist die Darstellung der Himmelfahrt Jesu, die ihn krönt. Die krönende Figur ist die Skulptur des Erzengels Raphael.