Das von Abderramán III. im 10. Jahrhundert errichtete Minarett ist nach und nach verschwunden, nachdem es teilweise abgerissen und von dem heute sichtbaren Glockenturm aus der Renaissance überbaut wurde, der von Hernán Ruiz III. entworfen und zwischen 1593 und 1617 errichtet wurde. Das ursprüngliche Aussehen des Minaretts wurde jedoch von Félix Hernández Giménez anhand von archäologischen Funden, historischen Texten und Darstellungen wie der im Portal von Santa Catalina rekonstruiert, auf der das Bauwerk vor seiner Rekonstruktion zu sehen ist.

Das ursprüngliche Minarett war 47 Meter hoch und hatte eine viereckige Grundfläche von 8,5 Metern auf jeder Seite. Wie andere spätere andalusische und nordafrikanische Minarette bestand es aus einem Hauptteil und einem zweiten, ebenfalls quadratischen Turm oder einer "Laterne", die es krönte. Dieser zweite Körper wurde von einer Kuppel und einem Yamur gekrönt, in dem zwei goldene und eine silberne Metallkugel (oft als "Äpfel" bezeichnet) untergebracht waren, deren Größe nach oben hin abnahm. Der Hauptteil beherbergte zwei Treppen, die über verschiedene Eingänge auf- und absteigen konnten. Auf halber Höhe wurde die Treppe durch drei Fenster in Hufeisenbögen erhellt, die mit abwechselnd farbigen Voussoirs verziert und von einem rechteckigen Alfiz umgeben waren, das dem der Außentüren der Moschee ähnelte. Diese Dreiergruppe von Fenstern wiederholte sich im Obergeschoss, und darüber, im obersten Stockwerk des ersten Baukörpers, befand sich eine Reihe von neun kleinen Fenstern mit der gleichen Form und Verzierung. Der Rand des ersten Korpus war mit einer Balustrade aus sägeförmigen Zinnen gekrönt, wie man sie in Marokko häufig findet. Die Laterne war auf jeder Seite mit einem Hufeisenbogen verziert, wobei sich die Farben der von einem Alfiz eingerahmten Voussoirs wieder abwechselten.

Der Bau des neuen Glockenturms der Kathedrale, der das Minarett umhüllte, begann 1593 und wurde nach einigen Verzögerungen 1617 abgeschlossen. Der Entwurf stammte von dem Architekten Hernán Ruiz III., der das Bauwerk bis zur Höhe der Glocken errichtete, aber vor seiner Fertigstellung starb.5469 Das Projekt wurde von Juan Sequero de Matilla fortgesetzt und vollendet und erreichte eine Höhe von 54 Metern, das höchste Bauwerk der Stadt. Der Glockenturm besteht aus einem massiven viereckigen Baukörper, der bis zur Höhe der Glocken reicht und an dessen Seiten sich Serlianen befinden. Über dieser Struktur befindet sich eine Laterne, die wiederum von einer Kuppel gekrönt wird, auf deren Spitze sich eine Skulptur des Erzengels Raphael befindet, die von Pedro de la Paz und Bernabé Gómez del Río geschaffen und 1664 von Gaspar de la Peña aufgestellt wurde, der mit der Lösung baulicher Probleme beauftragt war. Im Sockel des Turms befindet sich das Perdón-Tor, eines der beiden Nordtore des Gebäudes.