Die Kapelle San Bartolomé befindet sich in der Mihrab-Mauer und beherbergt die sterblichen Überreste des berühmten cordovanischen Dichters Luis de Góngora y Argote. Sie wurde im 13. Jahrhundert von Martín Muñoz gegründet und ging später in den Besitz der Familie Fernández de Córdoba über.

Es hat einen viereckigen Grundriss und eine gewölbte Decke mit einer Laterne, die stark verändert wurde und von der eine silberne Lampe herabhängt. Im Altaraufsatz hinter dem Altar, der mit Mudéjar-Kacheln aus dem 15. Jahrhundert bedeckt ist, befindet sich eine Leinwand mit der Darstellung des Martyriums des Heiligen Bartholomäus, eine Kopie des Originals von José de Ribera aus dem Jahr 1626. Der Altaraufsatz ist aus unvergoldetem geschnitztem Holz gefertigt und mit zahlreichen Pflanzenmotiven verziert.

Der Altar und die Wandfliesen stammen aus dem 15. Jahrhundert und sind aus derselben Zeit. Das Gitter, das die Kapelle abschließt, stammt ebenfalls aus dem 15. Jahrhundert, und auf ihm befindet sich ein Wappen mit dem Familiennamen Góngora.